Τελικά δεν μου δουλεύει το iBooks. Θα δοκιμάσω το iBooks fix και επανέρχομαι!
Εγκατέστησα το ibooks fix 2 από http://repo.insanelyi.com και τώρα το ibooks δουλεύει κανονικά

Κατέβασα activator, ζήτησε respring, έκανα, δουλεύει χωρίς να μου δείχνει safe mode.
Όταν με το καλό σταματήσει να κατεβάζει το cydia θα δοκιμάσω και appsync.